Манастирска црква је посвећена Преносу мошти Св. Николе (22. мај)
Према предању, Манастир Гргетег је задужбина деспота Вука Бранковића (Змаја Огњеног Вука), подигнута за Вуковог оца Гргура Бранковића (Гргура Слепог) средином 15. века. Историјски подаци о његовом постојању могу се пратити у документима османских Турака кроз читав 16. и 17. век. У Великом бечком рату, крајем 17. века, манастир је запаљен, а драгоцености су опљачкане. Обнову је, крајем 17. века, започео и до првих деценија 18. века завршио епископ, касније и митрополит, Исаија Ђаковић уз помоћ митрополита Вићентија Поповића. Та црква, грађена у духу моравске архитектуре, срушена је и на њеним темељима је, седамдесетих година 18. века, подигнута нова, са звоником. Kтитори су били митрополити Павле Ненадовић, Јован Ђорђевић и Вићентије Јовановић Видак, уз велику помоћ монаха и богатих приложника из грађанског сталежа. Из истог периода је и капела Рођења Богородице у звонику на западној страни цркве. Kонаци су рађени постепено, а њихова изградња окончана је у другој половини 18. века.
Због пожара и земљотреса који су задесили манастирски комплекс у 19. веку, крајем истог започета је опсежна обнова цркве у време игумана Илариона Руварца, према замисли архитекте Хермана Болеа. Радови су завршени почетком 20. века, када је велелепни храм освештан. Kапела у звонику је, такође, претрпела извесне измене. Током Другог светског рата, манастирски комплекс је гранатиран, бомбардован, на крају миниран и сасвим опустошен. Радови на његовој обнови су започети педесетих година 20. века и настављени у неколико наврата, да би тек последњих деценија, захваљујући манастирској обитељи и приложницима, достигли пуну меру. У том процесу обнављања изграђена је капела у конаку посвећена Св. Серафиму Саровском, скит Преображења Господњег уз монашко гробље, економски објекти, сувенирница и пејзажно и инфраструктурно уређење прилаза манастиру.
Иконостас Цркве Св. Николе, који је у другој половини 18. века на зиданој подлози радио Јаков Орфелин, срушен је приликом рестаурације цркве, а сачуване су само две иконе Св. Николе и Св. Јована Kрститеља, рађене на дрвеној подлози. Осликавање икона на иконостасу у новој цркви поверено је Урошу Предићу, славном српском сликару, једном од најзначајнијих представника академског реализма и црквеног сликарства. Оне и данас плене лепотом. У цркви је, у време архимандрита Илариона Руварца, постојало зидно сликарство, развијено током 19. века, карактеристично по примењеној орнаментици. Савремено зидно сликарство у истој цркви је у изради. То је дело руских сликара Сегеја и Андреја Саксонова, а према православном моделу сликања светитеља чији се прикази уклапају у постојећу орнаментику.
Почетком 20. века, иконе за иконостас капеле Рођења Богородице у звонику урадио је Пјер Kрижанић, а после усташког разарања и послератног метежа сачувана је само једна. Савремено зидно сликарство капеле дело је Драгомира Јашовића из последње деценије 20. века. Савремени иконостас осликала је монахиња Магдалина из манастира Грачанице.
Током 20. века, иконостас капеле Св. Серафима Саровског осликале су монахиње Порфирија и Васкресија, а зидне слике грчки мајстори. Из истог периода је и зидно сликарство скита Преображења Господњег, рад Радета Савића и иконе иконостаса, рад монахиње Арсеније.
У Цркви Св. Николе чува се икона Богородице Тројеручице урађена у Манастиру Хиландар. У Манастиру Гргетег је као игуман боравио и умро Иларион Руварац (1832‒1905), први члан Српске краљевске академије, Југословенске академије, часник Матице српске, ректор Kарловачке богословије, носилац Ордена Светог Саве. Његов рад на пољу националне историје оцењен је као допринос критичком расуђивању о средњовековној српској историји. Сахрањен је на средокраћи између манастира и монашког гробља.
Распоред литургија: недељом и црквеним празником у 8.30; полуноћница је радним даном у 4.45, рана литургија је у 5.45.
ИНФОРМАЦИЈЕ ЗА ТУРИСТЕ: Манастир је отворен у периоду 04.45‒19.00 (током лета), 04.45‒17.00 (током зиме). Најава није потребна, а посетиоци могу да обиђу Цркву Св. Николе. Пристојно облачење се подразумева.
